Авто с наследниками, с точки зрения регистрации, не проблемные. Регистрировать авто на себя, наследник авто не обязан и это не нужно. Если вам так спокойнее (а многие ошибочно считают регистрацию в ГИБДД более надежной чем документ о вступлении в наследство) то можете попросить наследников предварительно перерегистрировать уплатив за них гос. пошлину.
С точки зрения закона, разницы нету. Для того чтобы ГИБДД могли произвести регистрационные действия с авто, им нужен документ подтверждающий право продавца на владение продаваемым автомобилем. Таким документом, в том числе, может быть и свидетельство о вступлении в наследство.
С точки зрения практики, если автомобиль проблемный и на него, к примеру, по каким то причинам претендуют несколько "владельцев", то через суд у вас его могут отобрать независимо от того по каким документам и у кого вы его покупали, и то что ГИБДД его на вас благополучно зарегистрировало не будет иметь значения.
То есть, вам нужно достаточно убедиться в том что автомобиль принадлежит продавцу и только продавцу который вам его продаёт. Подтверждением этого может служить действительная регистрация в ГИБДД на продавца (ПТС + СТС), свидетельство о вступлении в наследство (выданное нотариусом и заверенное надлежащим образом), ДКП о продаже автомобиля вашему продавцу прежним владельцем, и прочие документы.
В третьем случае с предыдущим ДКП я был бы особенно осторожен если документ составлялся без нотариуса т.к. он может быть ненастоящим. Естественно остальные документы при желании тоже можно подделать но это чуть сложнее.
И еще, обязательно вставьте в ваш ДКП пункт о том что продавец гарантирует передачу вам ТС свободным от интресов третьих лиц и т.п. Также, всегда просите копию паспорта продавца, т.к. может пригодиться в случае проблем.